報(bào)告題目：多體蛋白質(zhì)相互作用復(fù)合物的結(jié)構(gòu)機(jī)理和計(jì)算方法

　　報(bào) 告 人：龔新奇 研究員 中國(guó)人民大學(xué)

　　時(shí) 間：2019年12月22日（周日）10:30 --

　　地 點(diǎn)：新波譜樓12樓1217報(bào)告廳

　　報(bào)告人簡(jiǎn)介：

　　龔新奇，從事計(jì)算生物學(xué)和機(jī)器學(xué)習(xí)算法研究，博士后在清華大學(xué)師從著名生物學(xué)家施一公院士。目前擔(dān)任中國(guó)人民大學(xué)數(shù)學(xué)科學(xué)研究院數(shù)學(xué)智能應(yīng)用實(shí)驗(yàn)室主任、研究員、副教授、博士生導(dǎo)師，中國(guó)人民大學(xué)數(shù)學(xué)學(xué)院學(xué)位委員會(huì)委員、師德建設(shè)與監(jiān)督委員會(huì)委員，清華大學(xué)北京生物學(xué)高精尖創(chuàng)新中心合作研究員Co-PI，哈佛大學(xué)數(shù)學(xué)中心丘成桐先生訪問(wèn)學(xué)者，IBM公司高性能計(jì)算訪問(wèn)學(xué)者，中國(guó)計(jì)算機(jī)學(xué)會(huì)高級(jí)會(huì)員和生物信息學(xué)專業(yè)委員會(huì)員。已發(fā)表SCI論文56篇，被引2123次，H指數(shù)23，發(fā)表的期刊包括Nature/Science/PNAS/Proteins/Bioinformatics/中國(guó)科學(xué)/IEEE-ACM TCBB等。主持科研項(xiàng)目8個(gè)，包括國(guó)家自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目、國(guó)家自然科學(xué)基金重點(diǎn)集成項(xiàng)目子課題、國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室開放課題等。為科學(xué)出版社發(fā)行的《蛋白質(zhì)模擬》和《計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)》等兩本生物信息學(xué)專著分別撰寫一章。 　

　　摘要:

　　在前期蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)分子對(duì)接研究的基礎(chǔ)上，結(jié)合近期實(shí)驗(yàn)上因?yàn)槔鋬鲭婄R技術(shù)革命而解析的更大多體蛋白質(zhì)復(fù)合體，我的實(shí)驗(yàn)室近年來(lái)聚焦多體蛋白質(zhì)相互作用復(fù)合物的計(jì)算和預(yù)測(cè)。我們挖掘了多體蛋白質(zhì)相互作用的幾何特征，發(fā)現(xiàn)了界面氨基酸配對(duì)的新規(guī)則，開發(fā)了預(yù)測(cè)兩體、三體和四體等蛋白質(zhì)相互作用時(shí)的界面氨基酸配對(duì)的深度學(xué)習(xí)算法。我們比較了多體蛋白質(zhì)復(fù)合物中不同界面的差異，發(fā)現(xiàn)有些界面是重要的熱點(diǎn)界面，比其他界面更容易形成、作用更突出。我們發(fā)現(xiàn)蛋白質(zhì)相互作用過(guò)程符合數(shù)學(xué)的雙泡理論，能精準(zhǔn)而高效的預(yù)測(cè)相互作用復(fù)合物的拓?fù)浜徒Y(jié)構(gòu)。

　　歡迎參加！